Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms