Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTMR11A4FU01 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms