Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDY1Q9Y6F8 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDY1Q9Y6F8 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms