Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms