Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms