Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms