Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIMKLBQ9ULI2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms