Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms