Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms