Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXC5

MIOS, GATOR complex protein MIOS, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIOSQ9NXC5 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MIOSQ9NXC5 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MIOSQ9NXC5 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms