Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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