Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms