Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms