Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms