Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms