Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARD11Q9BXL7 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms