Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms