Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COPS8Q99627 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
COPS8Q99627 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COPS8Q99627 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COPS8Q99627 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COPS8Q99627 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COPS8Q99627 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COPS8Q99627 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
COPS8Q99627 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS8Q99627 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms