Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms