Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms