Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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