Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms