Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2Q92932 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms