Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms