Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms