Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms