Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms