Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPTE2Q6XPS3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms