Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ZFAND6-220ENST00000561060 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 RGL4-201ENST00000290691 2885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms