Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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ZNF549Q6P9A3 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF549Q6P9A3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF549Q6P9A3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF549Q6P9A3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF549Q6P9A3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ZNF549Q6P9A3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ZNF549Q6P9A3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF549Q6P9A3 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF549Q6P9A3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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ZNF549Q6P9A3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ZNF549Q6P9A3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ZNF549Q6P9A3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF549Q6P9A3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF549Q6P9A3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF549Q6P9A3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF549Q6P9A3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF549Q6P9A3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF549Q6P9A3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF549Q6P9A3 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF549Q6P9A3 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ZNF549Q6P9A3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ZNF549Q6P9A3 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ZNF549Q6P9A3 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF549Q6P9A3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ZNF549Q6P9A3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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ZNF549Q6P9A3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF549Q6P9A3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF549Q6P9A3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF549Q6P9A3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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