Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms