Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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