Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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ECM1Q16610 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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ECM1Q16610 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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ECM1Q16610 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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ECM1Q16610 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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ECM1Q16610 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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ECM1Q16610 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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ECM1Q16610 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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ECM1Q16610 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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ECM1Q16610 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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ECM1Q16610 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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