Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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SNAPC1Q16533 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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SNAPC1Q16533 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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SNAPC1Q16533 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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SNAPC1Q16533 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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SNAPC1Q16533 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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SNAPC1Q16533 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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