Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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DDB1Q16531 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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