Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SSX1Q16384 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SSX1Q16384 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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SSX1Q16384 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SSX1Q16384 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SSX1Q16384 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SSX1Q16384 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SSX1Q16384 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SSX1Q16384 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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