Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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