Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms