Protein–RNA interactions for Protein: Q15648

MED1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED1Q15648 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED1Q15648 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED1Q15648 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED1Q15648 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MED1Q15648 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED1Q15648 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED1Q15648 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED1Q15648 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED1Q15648 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED1Q15648 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MED1Q15648 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MED1Q15648 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED1Q15648 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED1Q15648 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MED1Q15648 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED1Q15648 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED1Q15648 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED1Q15648 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED1Q15648 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED1Q15648 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED1Q15648 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED1Q15648 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED1Q15648 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED1Q15648 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED1Q15648 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MED1Q15648 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED1Q15648 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED1Q15648 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED1Q15648 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MED1Q15648 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED1Q15648 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED1Q15648 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MED1Q15648 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MED1Q15648 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED1Q15648 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED1Q15648 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED1Q15648 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED1Q15648 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED1Q15648 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED1Q15648 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED1Q15648 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED1Q15648 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED1Q15648 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED1Q15648 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED1Q15648 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED1Q15648 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED1Q15648 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED1Q15648 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED1Q15648 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED1Q15648 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED1Q15648 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED1Q15648 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED1Q15648 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MED1Q15648 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED1Q15648 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MED1Q15648 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MED1Q15648 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MED1Q15648 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MED1Q15648 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED1Q15648 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED1Q15648 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED1Q15648 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED1Q15648 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED1Q15648 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED1Q15648 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED1Q15648 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED1Q15648 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED1Q15648 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms