Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms