Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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