Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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SPIDRQ14159 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SPIDRQ14159 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SPIDRQ14159 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SPIDRQ14159 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SPIDRQ14159 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SPIDRQ14159 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SPIDRQ14159 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SPIDRQ14159 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SPIDRQ14159 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SPIDRQ14159 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SPIDRQ14159 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SPIDRQ14159 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SPIDRQ14159 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SPIDRQ14159 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SPIDRQ14159 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SPIDRQ14159 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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