Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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GTF2H3Q13889 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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GTF2H3Q13889 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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GTF2H3Q13889 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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GTF2H3Q13889 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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GTF2H3Q13889 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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GTF2H3Q13889 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms