Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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