Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms