Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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