Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 LSMEM1-202ENST00000439068 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 CKMT2-AS1-206ENST00000511495 585 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC096759.2-202ENST00000515230 777 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC126474.1-201ENST00000623555 1293 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 LINC01393-202ENST00000435981 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC073911.2-201ENST00000624989 468 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
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