Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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RPA4Q13156 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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RPA4Q13156 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RPA4Q13156 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RPA4Q13156 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RPA4Q13156 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RPA4Q13156 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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