Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms