Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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FOXF2Q12947 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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FOXF2Q12947 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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FOXF2Q12947 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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FOXF2Q12947 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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FOXF2Q12947 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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